Hur mäter jag en hjärntumör som en 3d-volym?

De säger att de kan kombinera 2D-bilderna för att visualisera 3D-volymen, men det är inte sant.

Nuvarande radiologimetoder mäter fortfarande tumörer i hjärnan och andra delar av kroppen i 2D. Detta kommer från de dagar då röntgen visades på film. Med uppfinningen av MR- och CT-skannrarna kom förmågan att "se" tumörerna i 3D. Problemet är att majoriteten av radiologer inte var utbildade i att använda en dator för att visa bilder i 3D. De utbildades för att titta på film. " Läs en bild" är vad de säger. De säger att de kan kombinera 2D-bilderna för att visualisera 3D-volymen, men det är inte sant.

Steg

1

Be en kirurg be om ett "3d" -protokoll för MR-skanning. Detta blir vanligt eftersom kirurger använder programvara för bildstyrd kirurgi i OR. Protokollet är 1 mm skivor, inget avstånd, 512x512 upplösning, kontrastinjektion.
2
Se till att radtech förstår vad du vill ha. Om du inte får bra data kan du inte få en 3D-volym. Detta kommer förmodligen att vara en Axial 3D SPGR 1mm utan avstånd om du instruerade radtech att göra det. Det är bäst att få en 3D-skanning i alla tre planen, Axial, Sagital och Coronal.
- Radiologen vet inte hur man använder MR-maskinen eller programvaran så du måste instruera RadTech vad du vill ha. Radiolog vill "formatera" en skanning.
  - Detta ger inte bra 3D-data för sekvensering. Du kan också be att bara skanna tumörområdet. Det här är en ny funktion på GE-skannrar och de flesta Rad Techs vet vad de ska göra, men radiologerna är förlorade eftersom det inte var en funktion de hade under filmens förflutna dagar. De är vana vid att titta på hela huvudet, istället för bara regionen där tumören är.
3

Hämta CD med dicom-data från radiolog. Detta borde vara den enkla delen, men Radtech kan inte fakturera för detta och front office-tjejerna är inte datorkyndiga, så det blir svårt. De måste göra det nu, så insistera. Radiologer är mycket skyddande för sina uppgifter. Det som är bra, är det inte deras data, det är ditt.
4

Ladda upp innehållet på CD till dropbox eller Google Drive. Om du har det i molnet kan du komma åt det från vilken enhet som helst.

Om du inte får bra data kan du inte få en 3D-volym.
5

Installera "onis" gratis DICOM-visningsversion på PC. De har ingen MAC-version än. De flesta radiologer ger en gratis version av en tittare på CD: n med dina data. Dessa låter dig inte "exportera" dicom-bilderna i ett format som kan läsas av 3D-sekvenseringsprogrammet.
6

Ställ in "banor" i ONIS till din dropbox-mappplats på din lokala dator.
7

Dubbelklicka på den bästa studien för 3d. Börja med Axial 3D SPGR 1mm 512x512-serien. Bläddra med musen upp och ner för att se varje bild i serien. Du kan ha hundratals skivor. Högerklicka på bilden och välj "Exportera". Exportera alla dicom-bilder till en ny mapp med namnet "Datum för skanning - modalitet - upplösning" eller "2013,06.04 AX SPGR 1mm" Detta är viktigt eftersom du förmodligen kommer att mäta tumören över tiden.
8

Klicka på ÖPPNA och ändra namnet på den mapp som skapas till "2013,06
9

Installera "itk-snap" 2,2 gratisversion. Den senaste versionen 2,4 ger mig snedvridningar av Sagital och Coronal åsikter. Detta byggs av University of Pennsylvania och fungerar bra.
10

Klicka på fil / ladda från bilden. Välj den Onis-exportmapp du skapade.

Läs också: Hur hanterar du sömnlöshet?